Geneious Biologics注釋算法擊敗IgBLAST,MiXCR
Geneious針對(duì)專業(yè)治療性抗體發(fā)現(xiàn)的強(qiáng)大生物信息學(xué)支持白皮書下載
周四,2018年5月3日,上午9:44
新聞稿:Geneious Biologics
MiXCR表示,Geneious Biologics注釋算法擊敗IgBLAST。
新西蘭奧克蘭 - 2018年5月2日 - 今天發(fā)布的白皮書顯示,針對(duì)抗體篩選和發(fā)現(xiàn)的商業(yè)軟件解決方案Geneious Biologics開發(fā)的注釋算法優(yōu)于開源序列分析軟件IgBLAST和MiXCR。
白皮書概述了為什么準(zhǔn)確的抗體序列注釋對(duì)于進(jìn)行治療性抗體研究的公司很重要。生物藥物開發(fā)涉及越來(lái)越多的抗體序列數(shù)據(jù)。這引入了圍繞準(zhǔn)確篩選大量候選序列的核心問題,短時(shí)間尺度內(nèi)以確定最有希望的、有用的。?
在一系列比較測(cè)試中,MiXCR 2.1.9,IgBLAST和Geneious Biologics注釋算法的任務(wù)是分析相同的數(shù)據(jù)集 - 美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心(NCBI)參考數(shù)據(jù)庫(kù)SRR5754964(Human)。
由于缺乏行業(yè)黃金標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)集,因此評(píng)估序列注釋的準(zhǔn)確性是困難的,然而,與IgBLAST和MiXCR相比,Geneious Biologics在注釋CDR區(qū)和生殖系基因方面的表現(xiàn)與三種算法的一致結(jié)果最相關(guān)。在Geneious Biologics不同意共識(shí)結(jié)果的極少數(shù)情況下,生物信息學(xué)家密切審查結(jié)果,并確定Geneious Biologics總體上是正確的,而MiXCR和I??gBLAST都不正確,表明Geneious Biologics相對(duì)于這些流行的開源工具具有優(yōu)越的性能。
白皮書作者兼Geneious Biologics Solutions副總裁Jannick Bendtsen博士說:“速度和準(zhǔn)確性對(duì)于進(jìn)行高度特異性研究以確定和驗(yàn)證潛在治療性抗體候選物的組織絕對(duì)重要。
“很少有現(xiàn)有的軟件提供商提供滿足專業(yè)治療性抗體研究人員速度和精度要求的解決方案。因此,我們大力投資開發(fā)以確保Geneious Biologics提供一流的技術(shù)來(lái)加速治療性抗體的發(fā)現(xiàn),“Bendtsen博士說。
下載白皮書 - 針對(duì)專業(yè)治療性抗體發(fā)現(xiàn)的強(qiáng)大生物信息學(xué)支持。下載地址:https://www.geneious.com/biologics/resources/
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